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Git est un système de contrôle de version permettant de suivre les modifications apportées aux fichiers informatiques et de coordonner le travail sur ces fichiers entre plusieurs personnes.

Site officiel.

Article Iryna Mykhailova · Oct 21, 2025 2m read

Bonjour,

Je voulais partager avec vous une méthode pratique qui m'a été utile lors de mes développements sur Health Connect Cloud avec VS Code et GitBash. Lors de ces développements, si des modifications sont effectuées directement sur le serveur, comme des règles de routage ou des déploiements de composants, elles ne sont pas automatiquement incluses dans le contrôle de code source. Vous devez donc exporter les modifications depuis le serveur vers vos fichiers locaux et les envoyer vers votre dépôt distant. Je suis sûr qu'il existe des méthodes plus simples pour gérer ce problème, que je suis en train de tester, mais pour une solution rapide, j'ai pensé qu'il serait utile d'utiliser une méthode de pré-validation qui déclenche un rappel dans GitBash – voir ci-dessous.

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Article Iryna Mykhailova · Oct 2, 2025 25m read

Table des matières

  1. Objectif de l'article
  2. Les conteneurs : définition et pertinence dans le cadre d'IRIS
     2.1 Les conteneurs et les images en quelques mots
     2.2 Avantages des conteneurs pour les développeurs
     2.3 Pourquoi IRIS fonctionne bien avec Docker
  3. Conditions préalables
  4. Installation de l'image InterSystems IRIS
     4.1 Utilisation de Docker Hub
     4.2 Extraction de l'image
  5. Exécution de l'image InterSystems IRIS
     5.1 Démarrage d'un conteneur IRIS
     5.2 Vérification de l'état des conteneurs
     5.3 Exécution de code dans le terminal conteneur
     5.4 Accès au portail de gestion IRIS
     5.5 Connexion du conteneur à VS Code
     5.6 Arrêt ou suppression du conteneur
     5.7 Configuration d'un mot de passe spécifique avec un montage de type bind
     5.8 Utilisation de volumes %SYS durables
      5.8.1 Contenu stocké sous %SYS durable
      5.8.2 Comment activer %SYS durable
  6. Utilisation de Docker Compose
     6.1 Exemple d'utilisation de l'outil Docker Compose
     6.2 Exécution de Docker Compose
  7. Utilisation d'un fichier Dockerfile pour l'exécution d'un code source personnalisé
     7.1 Exemple de fichier Dockerfile
     7.2 Exemple de Docker Compose
     7.3 Compréhension des couches, du balisage des images et de la différence entre le temps de compilation et le temps d'exécution
     7.4 Code source et script d'initialisation
     7.5 Création de l'image avec le fichier Dockerfile
     7.6 Exécution d'instructions dans le terminal IRIS conteneurisé
  8. Conclusion et suite


1. Objectif de l'article

La communauté de développeurs InterSystems propose déjà de nombreux articles intéressants qui expliquent le fonctionnement de Docker, les commandes les plus importantes et plusieurs cas d'utilisation d'InterSystems IRIS dans un environnement conteneurisé.

Les articles de cette série ont un objectif quelque peu différent. Je suis un grand fan des guides étape par étape, c'est pourquoi je souhaite créer un guide complet sur la configuration et l'utilisation de Docker avec InterSystems IRIS, en commençant par les bases pour ensuite passer progressivement à des scénarios plus avancés tels que les instances à espaces de noms multiples, les conteneurs interconnectés, les intégrations avec des systèmes externes et les applications comprenant une interface utilisateur.

2. Les conteneurs : définition et pertinence dans le cadre d'IRIS

2.1 Les conteneurs et les images en quelques mots

Traditionnellement, pour exécuter une application, il fallait faire correspondre sa version à celle de votre système d'exploitation et la packager pour cette cible spécifique. Dans le même temps, chaque application doit être conçue pour fonctionner spécifiquement avec un système cible. Si vous vouliez qu'une application fonctionne sous macOS et Windows, vous deviez modifier sa conception et la packager pour ces différents systèmes. Les images et conteneurs Docker constituent des technologies de déploiement d'applications qui résolvent ces problèmes en permettant aux développeurs de packager un logiciel une seule fois et de l'exécuter n'importe où. 

Docker est une plateforme logicielle qui regroupe des logiciels dans des conteneurs. Une image Docker, ou image de conteneur, est un fichier exécutable autonome contenant toutes les instructions (bibliothèques, dépendances et fichiers) nécessaires pour créer et exécuter un conteneur. Une image Docker est partageable et portable, ce qui vous permet de déployer la même image à plusieurs endroits à la fois. Un conteneur Docker est un environnement d'exécution qui contient tous les composants nécessaires pour exécuter le code de l'application sans utiliser les dépendances de la machine hôte.  

Contrairement aux machines virtuelles, les conteneurs sont légers. Ils n'ont pas besoin d'un système d'exploitation complet et fonctionnent directement sur le système d'exploitation hôte via le moteur Docker Engine en utilisant uniquement les binaires et les bibliothèques nécessaires à l'application spécifique, ce qui les rend plus efficaces. Plusieurs conteneurs isolés peuvent être lancés en même temps sur la même machine sans interférer les uns avec les autres.

2.2 Avantages des conteneurs pour les développeurs

  • Isolation: exécution dans un environnement propre et reproductible sans affecter le système hôte.
  • Reproductibilité: assurance que la configuration fonctionne de la même manière sur différentes machines.
  • Configuration facile: lancement d'une instance IRIS en quelques secondes à l'aide d'une seule commande, sans installation manuelle.

2.3 Pourquoi IRIS fonctionne bien avec Docker

L'exécution d'InterSystems IRIS dans Docker présente plusieurs avantages:

  • L'application peut être exécutée et testée dans des conteneurs isolés,
  • Il est possible d'utiliser des systèmes de contrôle de version partagés (tels que Git) au lieu de travailler directement sur le serveur
  • L'environnement conteneurisé peut être répliqué à n'importe quelle étape, ce qui garantit la cohérence tout au long du cycle de vie du logiciel.
  • Votre application peut facilement être exécutée sur n'importe quel ordinateur.

3. Conditions préalables

Pour exécuter InterSystems IRIS dans un conteneur Docker, il faut que vous ayez:

4. Installation de l'image InterSystems IRIS

4.1 Utilisation de Docker Hub

Docker Hub est le registre central des images Docker. Il fournit une vaste bibliothèque d'images pré-construites que vous pouvez utiliser comme point de départ. InterSystems y publie les images officielles IRIS Community Edition que vous pouvez télécharger pour exécuter IRIS localement dans votre conteneur. Vous pouvez également utiliser Docker Hub pour pousser vos propres images personnalisées afin de les partager au sein de votre équipe ou de les distribuer à la communauté. Docker Hub est disponible en ligne et intégré à Docker Desktop.

4.2 Extraction de l'image

Voici quelques commandes courantes pour les images Docker :

CommandeDescription
docker pull <image>Téléchargement d'une image depuis Docker Hub
docker imagesRépertoire de toutes les images locales
docker rmi <image>Suppression d'une ou plusieurs images

Vous trouverez la commande pull exacte directement sur la page Docker Hub de l'image:

Pour l'image InterSystems IRIS, la commande est comme suit:

docker pull intersystems/iris-community:latest-cd

Vous pouvez également rechercher iris-community dans la barre de recherche de Docker Desktop et cliquer sur Pull:

Une fois l'installation terminée, l'image InterSystems IRIS devrait apparaître dans la liste de vos images locales:

5. Exécution de l'image InterSystems IRIS

Une fois l'image InterSystems IRIS extraite de Docker Hub, vous pouvez l'exécuter dans un conteneur. 

Voici les principales commandes pour les conteneurs Docker:

CommandeDescription
docker run -d <image>Exécution en mode détaché : démarrer le conteneur en arrière-plan et renvoyer immédiatement le contrôle au terminal.
docker run -p <host>:<container> <img>Mappage du port hôte vers le port du conteneur
docker psListe des conteneurs en cours d'exécution
docker ps -aListe de tous les conteneurs (y compris les conteneurs arrêtés)
docker exec -it <container> bashExécution d'une commande dans un conteneur en cours d'exécution
docker logs <container>Affichage des journaux d'un conteneur
docker stop <container>Arret d'un conteneur en cours d'exécution
docker start <container>Démarrage d'un conteneur arrêté
docker restart <container>Redémarrage d'un conteneur
docker rm <container>Suppression d'un conteneur

5.1 Démarrage d'un conteneur IRIS

Vous pouvez démarrer un conteneur InterSystems IRIS Community Edition nommé "my-iris" via l'interface utilisateur Docker Desktop en cliquant simplement sur le bouton Run de l'image que vous souhaitez exécuter dans le panneau Images. Pour l'image InterSystems, il est possible de spécifier quelques paramètres facultatifs, tels que les ports à exposer sur votre machine hôte pour communiquer avec les services exécutés dans le conteneur.

Cela peut être fait via le menu ci-dessus, en considérant que:

  • côté gauche → port sur la machine hôte
  • côté droit → port à l'intérieur du conteneur

Ports IRIS courants (à l'intérieur du conteneur)

  • 1972 → Port Superserver : utilisé par IRIS pour les protocoles réseau (ObjectScript, JDBC, etc.).
  • 52773 → Port du serveur Web : utilisé par IRIS pour le portail de gestion (interface Web).

Si vous ne mappez pas explicitement les ports, Docker attribuera des ports aléatoires sur l'hôte.

Vous pouvez également exécuter le conteneur à l'aide du terminal:

docker run --name my-iris -d --publish 9091:1972 --publish 9092:52773 intersystems/iris-community:latest-cd

Dans cet exemple:

  • 9091 sur l'hôte est mappé à 1972à l'intérieur du conteneur (Superserver).
  • 9092 sur l'hôte est mappé à 52773 à l'intérieur du conteneur (Portail de gestion).

5.2 Vérification de l'état des conteneurs

Après avoir exécuté cette commande, exécutez docker ps pour vérifier si le conteneur fonctionne correctement.

> docker ps
CONTAINER ID   IMAGE                                   COMMAND                 CREATED         STATUS                            PORTS                                                                                        NAMES
907d4c2b4ab5   intersystems/iris-community:latest-cd   "/tini -- /iris-main"   3 seconds ago   Up 2 seconds (health: starting)   0.0.0.0:9091->1972/tcp, [::]:9091->1972/tcp, 0.0.0.0:9092->52773/tcp, [::]:9092->52773/tcp   my-iris

Les conteneurs en cours d'exécution sont également répertoriés dans le panneau Containers de Docker Desktop:

L'état des images associées sera "In Use" (En cours d'utilisation), comme indiqué dans le panneau Images :

5.3 Exécution de code dans le terminal conteneur

Une fois que le statut du conteneur indique Running (exécution), tout fonctionne correctement. 

Vous pouvez le tester en ouvrant le terminal du conteneur (cliquez sur le nom du conteneur dans le panneau de conteneurs (Containers) de Docker Desktop et accédez à Exec) et en saisissant:

iris session IRIS

Cela ouvre un terminal IRIS à l'intérieur du conteneur Docker, où vous pouvez utiliser la syntaxe ObjectScript standard pour exécuter des commandes et des scripts.

5.4 Accès au portail de gestion IRIS de l'instance conteneurisée

Ensuite, ouvrez votre navigateur et accédez à:

http://localhost:9092/csp/sys/UtilHome.csp

Par défaut, les conteneurs IRIS se servent de l'utilisateur _SYSTEM avec le mot de passe SYS. Il est nécessaire de changer le mot de passe après la connexion.

Cela vous donne un accès complet au portail de gestion IRISvous permettant de gérer les espaces de noms, les bases de données et d'autres fonctionnalités IRIS directement depuis l'interface web.

5.5 Connexion du conteneur VSCode

Vous pouvez connecter votre IDE préféré (tel que VS Code ou Studio) au conteneur IRIS à l'aide du port Superserver mappé (par défaut 1972 à l'intérieur du conteneur, par exemple, 9091 sur l'hôte) et du port du serveur Web (par défaut 52773 à l'intérieur du conteneur, par exemple, 9092 sur l'hôte). Cela vous permet de développer et de tester du code ObjectScript directement sur le conteneur en cours d'exécution.

Pour connecter le conteneur à VSCode:

  • Installez la solution InterSystems ObjectScript Extension Pack
  • Ouvrez l'extension InterSystems Server
  • Cliquez sur les trois points et sélectionnez "Edit server" (Modifier le serveur)
  •  
  • Cliquez sur "Modifier dans settings.json"
  • Ajoutez cet élément au fichier json "intersystems.servers":
"docker_iris": {
    "webServer": {
         "scheme": "http",
         "host": "localhost",
         "port": 9092
    },
    "description": "Connection to Docker container."
}
  • Maintenant le serveur est connecté. Vous pouvez vous connecter avec l'utilisateur _SYSTEM.
  • Comme vous pouvez le constater, l'espace de noms USER (UTILISATEUR) est le seul disponible:

5.6 Arrêt ou suppression du conteneur

Pour arrêter un conteneur en cours d'exécution, utilisez la commande:

docker stop my-iris

Redémarrage du conteneur

Pour redémarrer le conteneur, utilisez la commande

docker start my-iris

Suppression (effacement) du conteneur

Pour supprimer l'instance du conteneur, mais pas l'image, utilisez la commande: 

docker rm my-iris

La totalité des données contenues dans le conteneur sera perdue, sauf si vous avez monté des volumes (nous en parlerons dans les paragraphes suivants).

5.7 Configuration d'un mot de passe spécifique avec un montage de type bind

Il est possible de configurer un mot de passe personnalisé lors du démarrage d'un conteneur à l'aide d'un fichier de mots de passe. Le fichier sera enregistré sur notre hôte et copié dans le conteneur à l'aide du mécanisme bind mount .

Lorsque vous utilisez un bind mount, un fichier ou un répertoire sur la machine hôte est monté depuis l'hôte dans un conteneur, ce qui permet de partager le code source ou les artefacts de compilation entre un environnement de développement sur l'hôte Docker et un conteneur. 

  • Créez un fichier nommé password.txt contenant uniquement votre mot de passe sous forme de chaîne (attention! Notez votre mot de passe, vous en aurez besoin plus tard). 
  • Copiez le chemin d'accès, dans cet exemple ce sera C:\InterSystems\DockerTest\password\password.txt
  • Exécutez la commande suivante:
docker run --name my-iris -d --publish 9091:1972 --publish 9092:52773 --volume "C:\InterSystems\DockerTest:/durable" intersystems/iris-community:latest-cd --password-file /durable/password/password.txt 

Une fois le conteneur lancé, vous pouvez vous connecter avec l'utilisateur _SYSTEM et le mot de passe que vous avez enregistré dans votre fichier de mots de passe. 

À l'intérieur du conteneur Docker, vous verrez un fichier password.txt.done . Le même fichier se trouvera dans votre dossier hôte.

L'extension du fichier est remplacée par .done afin d'éviter la présence du mot de passe dans le texte brut. Il s'agit du comportement standard d'InterSystems IRIS avec les fichiers de mots de passe. Par conséquent, une fois le mot de passe lu à partir du fichier password.txt et l'utilisateur IRIS par défaut (_SYSTEM) mis à jour avec ce mot de passe, le fichier est mis à jour en ajoutant .done et en supprimant le mot de passe pour des raisons de sécurité.

Vous pouvez vous connecter au Portail de gestion à l'aide de votre mot de passe personnalisé (je vous avais dit de le noter :D). InterSystems IRIS ne vous obligera pas à changer le mot de passe après votre connexion.

Veuillez noter que si le conteneur est supprimé puis redémarré sans aucun volume durable monté (pour plus d'informations, voir le paragraphe suivant), le mot de passe ne sera pas relu à partir du fichier password.txt , car il a été remplacé par le fichier password.txt.done. Dans ce cas, le mot de passe standard "SYS" sera utilisé. 

5.8 Démarrage du conteneur avec un volume durable spécifique. Utilisation de volumes %SYS durables

Par défaut, tout ce que vous enregistrez dans un conteneur Docker en cours d'exécution disparaît lorsque vous le supprimez à l'aide de la commande docker rm <container's name> . 

Pour éviter de perdre vos données, InterSystems IRIS fournit la fonctionnalité durable %SYS. Cette fonctionnalité permet à l'instance de stocker tous les fichiers importants sur votre machine hôte, afin qu'ils survivent aux redémarrages du conteneur et de l'instance.

5.8.1 Contenu stocké sous %SYS durable

Voici quelques exemples:

  • Fichiers de configuration (iris.cpf, httpd.conf)
  • Configurations et journaux de la passerelle Web (/csp)
  • Bases de données système (IRIS, USER, IRISSECURITY, IRISTEMP, etc.)
  • Journaux, fichiers image d'écriture (WIJ) et fichiers temporaires
  • Fichiers journaux (messages.log, SystemMonitor.log, etc.)
  • Clé de licence (iris.key)
  • Toute autre base de données que vous avez créée

5.8.2 Comment activer %SYS durable

La première chose à faire est de choisir un dossier sur votre hôte, tel que C:\InterSystems\DockerTest

  • Sous Linux, assurez-vous qu'IRIS peut y écrire en créant l'utilisateur irisowner et en lui attribuant la propriété du répertoire:
adduser irisowner
chown -R irisowner:irisowner /InterSystems/DockerTest
  • Sous Windows, vous pouvez ignorer cette étape, car Docker Desktop will montera le dossier avec vos autorisations utilisateur Windows actuelles.

Ensuite, montez votre dossier hôte et indiquez à IRIS où écrire ses données durables à l'aide de la variable ISC_DATA_DIRECTORY:

  --volume "C:\InterSystems\DockerTest:/durable" --env ISC_DATA_DIRECTORY=/durable/iris

L'instruction complète à exécuter sur le terminal est la suivante:

docker run --name my-iris -d --publish 9091:1972 --publish 9092:52773 --volume "C:\InterSystems\DockerTest:/durable" --env ISC_DATA_DIRECTORY=/durable/iris intersystems/iris-community:latest-cd --password-file /durable/password/password.txt

À ce stade, vous pouvez inspecter votre conteneur et observer qu'un dossier durable est monté et contient les répertoires iris/ (pour le %SYS durable) et password/. Sur votre hôte, vous pouvez également voir les deux répertoires:

Si le conteneur est arrêté et supprimé, lorsque vous recréez le conteneur avec la même commande de Docker Compose IRIS restaurera son état précédent (utilisateurs, configuration, journaux, bases de données, etc.) à l'aide des données du dossier iris/, de sorte que rien ne soit perdu. Vous pouvez tester cette méthode en créant une application web, en arrêtant et en supprimant le conteneur, puis en le recréant une deuxième fois. Sans utiliser la fonctionnalité durable %SYS, toutes les modifications apportées à %SYS sont perdues lorsque le conteneur est supprimé et l'instance est lancée à chaque fois comme une nouvelle instance. 

Veuillez noter que si vous supprimez le dossier iris/, la prochaine fois que vous lancerez le conteneur IRIS, il sera initialisé comme lors d'une nouvelle installation, car il ne trouvera pas les données %SYS précédentes. Un tout nouveau dossier iris/ sera créé.

6. Utilisation de Docker Compose 

Jusqu'à présent, vous avez démarré InterSystems IRIS à l'aide d'une seule commande longue docker run. Cela fonctionne, mais il devient rapidement difficile de tout gérer avec des commandes shell simples.

Docker Compose est un fichier de configuration YAML qui permet de définir comment exécuter un ou plusieurs conteneurs. Cela simplifie le contrôle de l'ensemble de votre pile d'applications, facilitant la gestion des services, des réseaux et des volumes. Une seule commande vous permet de créer et de démarrer tous les services à partir de votre fichier de configuration.

Voici les commandes courantes pour Docker Compose:

CommandeDescription
docker compose up -dDémarrer tous les services définis dans docker-compose.yml en mode détaché (par défaut, utiliser le fichier docker-compose.yml du dossier courant).
docker compose -f ./path/to/docker-compose.yml up -dDémarrer les services à partir d'un fichier de composition dans un autre répertoire.
docker compose downArrêter et supprimer tous les conteneurs, réseaux et volumes créés par docker compose up.
docker compose psRépertorier les conteneurs gérés par Compose.
docker compose logsAfficher les journaux de tous les services définis dans le fichier Compose.
docker compose logs <service>Afficher les journaux d'un service spécifique (par exemple, iris).
docker compose exec <service> bashOuvrez un shell dans un conteneur en cours d'exécution géré par Compose.
docker compose stopArrêtez les conteneurs en cours d'exécution, mais ne les supprimez pas.
docker compose startDémarrer les conteneurs précédemment arrêtés.
docker compose restartRedémarrer tous les conteneurs définis dans le fichier Compose.
docker compose buildConstruire ou reconstruire les services définis par un fichier Dockerfile.
docker compose pullTélécharger la ou les dernières images pour les services.
docker compose configValider et afficher la configuration fusionnée à partir du fichier Compose.

6.1 Exemple d'utilisation de l'outil Docker Compose

Pour utiliser Docker Compose, il est nécessaire de créer un fichier docker-compose.yml contenant toutes les configurations du conteneur que l'on souhaite créer et démarrer.

Ainsi la commande suivante:

docker run --name my-iris -d --publish 9091:1972 --publish 9092:52773 --volume "C:\InterSystems\DockerTest:/durable" --env ISC_DATA_DIRECTORY=/durable/iris intersystems/iris-community:latest-cd --password-file /durable/password/password.txt

peut être remplacé par la suivante docker-compose.yml:

# docker-compose.yml     
services:
  iris:
    container_name: my-iris
    image: intersystems/iris-community:latest-cd
    init: true
    volumes:
      # Données système/persistantes (installation IRIS, bases de données, etc.)# Sous Windows, vous pouvez utiliser les deux options: "C:\\InterSystems\\DockerTest:/durable"
      - C:/InterSystems/DockerTest:/durable
      ports:
      - "9092:52773"# Portail de gestion / API REST
      - "9091:1972"# Port SuperServer
      environment:
      - ISC_DATA_DIRECTORY=/durable/iris
      # Utilisation du fichier de mots de passe pour se connecter au conteneur
      command: --password-file /durable/password/password.txt

6.2 Exécution de Docker Compose 

Ouvrez un terminal dans le répertoire où le fichier Docker Compose est enregistré (ou utilisez l'option -f) et exécutez la commande suivante:

docker compose up -d

Votre conteneur IRIS démarrera dans la configuration exacte spécifiée dans le fichier Docker Compose

Dans Docker Desktop, vous pouvez désormais voir qu'une pile composée appelée "dockertest" (elle prend le nom du dossier dans lequel Docker Compose est enregistré) a été créée et associée au conteneur "my-iris":

7. Utilisation d'un fichier Dockerfile pour l'exécution d'un code source personnalisé

Jusqu'à présent, vous avez exécuté InterSystems IRIS directement à partir de l'image Docker officielle. Cependant, nous aurons peut-être besoin de télécharger automatiquement des classes ObjectScript ou d'autres codes personnalisés dans l'image lors de sa création. 

Un fichier Dockerfileest un fichier texte contenant des instructions pour créer une image à partir d'une image de base (comme intersystems/iris-community:latest-cd). Grâce à un fichier Dockerfile, nous pouvons ajouter du code source personnalisé dans le conteneur et exécuter des commandes personnalisées lors de la création de l'image. 

7.1 Exemple de fichier Dockerfile

Le prochain exemple fournit un fichier Dockerfile qui effectue les opérations suivantes:

  • Démarrez l' image à partir de l'image officielle InterSystems IRIS.
  • Copiez le code de votre application depuis le dossier src/ vers le conteneur.
  • Exécutez un script pour importer les classes et initialiser l'application conteneurisée, puis enregistrez les journaux dans un fichier journal.
  • Exposez les ports InterSystems IRIS par défaut.

7.2 Exemple d'utilisation de l'outil Docker Compose

Vous devez également modifier Docker Compose afin de spécifier la création de l'image à partir du fichier Dockerfile situé dans le dossier courant:

# docker-compose.yml     
services:
  iris:
    container_name: my-iris
    build: # Cela indique à Docker de créer une nouvelle image basée sur celle spécifiée dans le fichier Dockerfile
      context: .        # Construction de l'image à partir du fichier Dockerfile local
      dockerfile: Dockerfile
    image: my-modified-iris-image:latest   # attribution d'une nouvelle balise à la nouvelle image afin d'éviter de remplacer l'image de base
    init: true
    volumes:
      # Données système/persistantes (installation IRIS, bases de données, etc.)# Sous Windows, vous pouvez utiliser les deux options: "C:\\InterSystems\\DockerTest:/durable"
      - C:/InterSystems/DockerTest:/durable
ports:
      - "9092:52773"# Portail de gestion / API REST
      - "9091:1972"# Port SuperServer
environment:
      - ISC_DATA_DIRECTORY=/durable/iris
    # Utilisation du fichier de mots de passe pour se connecter au conteneur
    command: --password-file /durable/password/password.txt

7.3 Compréhension des couches, du balisage des images et de la différence entre le temps de compilation et le temps d'exécution

Dans Docker, comme expliqué ici: Qu'est-ce qu'une image?, il y a deux principes importants à garder à l'esprit:

  1. Les images sont immuables: une fois qu'une image est créée, elle ne peut plus être modifiée. Vous pouvez uniquement créer une nouvelle image ou y ajouter des modifications.
  2. Les images de conteneur sont composées de couches: chaque couche représente un ensemble de modifications du système de fichiers qui ajoutent, suppriment ou modifient des fichiers.

De nouvelles couches sont ajoutées à une image lorsque les instructions spécifiées dans un fichier Dockerfile sont exécutées. Ces couches apparaîtront également dans les informations relatives à l'image.

Dans cette optique, il est très important de distinguer ce que fait Docker au temps de compilation (lorsqu'il crée une image à partir d'un fichier Dockerfile) et au temps d' exécution (lorsqu'il démarre un conteneur à partir de cette image).

Chacune de ces instructions Dockerfile est exécutée au temps de compilation

  • COPY: les fichiers sont copiés dans l'image
  • RUN: exécute des commandes et enregistre les résultats sous forme de nouvelles couches d'image
  • ENTRYPOINT: ne modifie pas le système de fichiers, mais définit le processus par défaut qui sera lancé au moment de l'exécution
  • EXPOSE: définit les métadonnées relatives aux ports que l'image prévoit d'utiliser

Au temps d'exécution, Docker ne reconstruit pas l'image, mais ajoute une couche de conteneur par-dessus. Toutes les modifications apportées pendant l'exécution du conteneur (comme les nouveaux fichiers, les modifications, les journaux) sont enregistrées dans cette couche temporaire.

D'après le dernier exemple fourni par Docker Compose:

build: # cela indique à Docker de créer une nouvelle image basée sur celle spécifiée dans le fichier Dockerfile
context: .        # Construction de l'image à partir du fichier Dockerfile local
dockerfile: Dockerfile
image: my-modified-iris-image:latest   # attribution d'une nouvelle balise à la nouvelle image afin d'éviter de remplacer l'image de base

Ces instructions indiquent à Docker de créer une nouvelle image appelée "my-modified-iris-image:latest" (ceci s'appelle un tag) en récupérant l'image de base et en la modifiant comme décrit dans le fichier Dockerfile. Il est très important de marquer la nouvelle image avec un nom distinct. Si nous évitons d'apposer une balise sur l'image nouvellement créée, l'image de base sera remplacée par la nouvelle. L'image officielle sera toujours disponible sur Docker Hub, mais cette version locale la masquera et tous les projets faisant référence à cette balise utiliseront désormais, sans le savoir, l'image personnalisée, contenant plusieurs nouvelles couches.

Pour éviter cela, utilisez toujours une balise distincte pour créer une nouvelle image distincte tout en conservant l'image de base officielle propre et réutilisable. 

7.4 Code source et script d'initialisation

À ce stade, nous devons créer au moins une classe et la placer dans le src/ dossier. La classe sera copiée dans le conteneur et importée via le iris.script fichier, qui contient toutes les instructions nécessaires pour importer les classes et initialiser l'application lors de la création de l'image.

Créez un nouveau répertoire appelé src/DockerStepByStep dans le dossier de votre projet et créez le fichier de classe suivant:

Class DockerStepByStep.cheers Extends%RegisteredObject
{

ClassMethod sayHi() As%Status { Set sc = $$$OKw"Hi mom!",! Return sc }

}

Dans la racine de votre projet, créez un fichier portant le nom iris.script:

// Non-expiration des mots de passe pour le mode devzn"%SYS"Do##class(Security.Users).UnExpireUserPasswords("*")

// Téléchargement des cours à partir d'une source fiablezn"USER"// Les classes à importerset importPath = "/opt/irisapp/src"write"Loading classes at '", importPath, "' ...", ! set errors = ""do$System.OBJ.Import(importPath,"cuk",,.errors) if errors = 0 { write"Classes loaded successfully", ! } else { write errors, " errors occurred while loading classes!", ! }

halt

7.5 Création de l'image avec le fichier Dockerfile

Pour la première exécution, vous pouvez utiliser la commande suivante pour créer l'image à partir du fichier Dockerfile (le drapeau --build force Docker à recréer l'image à partir de votre fichier Dockerfile):

docker-compose up --build

Pour les autres exécutions, si le fichier Dockerfile n'a pas été modifié, vous pouvez simplement exécuter ce qui suit: 

docker-compose up -d

Une fois la création de l'image lancée, vous verrez apparaître les journaux suivants dans le terminal:

PS C:\InterSystems\DockerTest> docker-compose up --build
[+] Building 21.5s (13/13) FINISHED
 => [internal] load local bake definitions                                                                     0.0s
 => => reading from stdin 530B                                                                                 0.0s
 => [internal] load build definition from Dockerfile                                                           0.0s
 => => transferring dockerfile: 1.73kB                                                                         0.0s
 => [internal] load metadata for docker.io/intersystems/iris-community:latest-cd                              10.0s
 => [internal] load .dockerignore                                                                              0.0s
 => => transferring context: 2B                                                                                0.0s
 => [1/6] FROM docker.io/intersystems/iris-community:latest-cd@sha256:93488df381f5868649e7bfc33a9083a3e86a22d  0.9s
 => => resolve docker.io/intersystems/iris-community:latest-cd@sha256:93488df381f5868649e7bfc33a9083a3e86a22d  0.0s
 => [internal] load build context                                                                              0.0s
 => => transferring context: 147B                                                                              0.0s
 => [2/6] WORKDIR /opt/irisapp                                                                                 0.0s
 => [3/6] COPY src src                                                                                         0.1s
 => [4/6] COPY iris.script .                                                                                   0.1s
 => [5/6] RUN mkdir -p /opt/irisapp/logs                                                                       0.3s
 => [6/6] RUN iris start IRIS &&     iris session IRIS < iris.script > /opt/irisapp/logs/build.log 2>&1 &&     4.5s
 => exporting to image                                                                                         4.5s
 => => exporting layers                                                                                        3.3s
 => => exporting manifest sha256:3ce316cefa21a3707251c4287005a15b02e6dc0151b24baf2a82f76064792250              0.0s
 => => exporting config sha256:00238e19edef86b29149d2eb89ff75f4d1465ba0d9a2ac4494a14d3bd3746a94                0.0s
 => => exporting attestation manifest sha256:3579cab5c8accc7958090276deb60bd7dbbc2ecbf13af8e7fa8c4ff2dfe91028  0.0s
 => => exporting manifest list sha256:17b969c340f57d611cc7603287cc6db50cffd696258a72b5648ece0a919676ac         0.0s
 => => naming to docker.io/intersystems/iris-community:latest-cd                                               0.0s
 => => unpacking to docker.io/intersystems/iris-community:latest-cd                                            0.9s
 => resolving provenance for metadata file                                                                     0.0s
[+] Running 3/3
 ✔ intersystems/iris-community:latest-cd  Built                                                                0.0s
 ✔ Network dockertest_default             Created                                                              0.1s
 ✔ Container my-iris                      Created                                                              0.2s 

À l'étape 6/6, le fichier iris.script est exécuté dans l'instance IRIS conteneurisée et les journaux sont enregistrés dans le chemin /opt/irisapp/logs/build.log.

Pour afficher les journaux, vous pouvez exécuter l'instruction suivante:

docker exec -it my-iris cat /opt/irisapp/logs/build.log

Vous devriez voir les enregistrements suivants qui vous informent du résultat de la compilation de la classe:

Node: buildkitsandbox, Instance: IRIS

USER>

USER>

%SYS>

%SYS>

%SYS>

%SYS>

USER>

USER>

USER>

USER> Loading classes at '/opt/irisapp/src' ...

USER>

USER>

Load of directory started on 09/16/202507:46:28 Loading file /opt/irisapp/src/DockerStepByStep/cheers.cls as udl

Compilation started on 09/16/202507:46:28 with qualifiers 'cuk' Class DockerStepByStep.cheers is up-to-date. Compilation finished successfully in 0.005s.

Load finished successfully.

USER> Classes loaded successfully

USER>

USER>

Sur Docker Desktop, vous pouvez voir qu'une nouvelle image appelée "my-modified-iris-image" a été créée et s'exécute parallèlement à l'image officielle de base.

Si vous examinez les images, vous constaterez que la version personnalisée est composée de 31 couches, contre 25 couches pour l'originale. Les nouvelles couches correspondent aux instructions exécutées au moment de la compilation par le fichier Dockerfile:

7.6 Exécution d'instructions dans le terminal IRIS conteneurisé

Pour tester les classes, vous pouvez activer le terminal Iris dans l'instance IRIS conteneurisée. Pour ce faire, exécutez l'instruction suivante:

docker exec -it my-iris iris session IRIS

À ce stade, vous pouvez invoquer la méthode de classe à partir de l'espace de noms USER à l'aide de la commande suivante:

do##class(DockerStepByStep.cheers).sayHi()

Finalement, vous devriez obtenir le résultat suivant:

PS C:\InterSystems\DockerTest> docker exec -it my-iris iris session IRIS

Node: 41c3c7a9f2e4, Instance: IRIS

USER>do##class(DockerStepByStep.cheers).sayHi() Hi mom!

8. Conclusion et suite

Nous avons parcouru l'ensemble du cycle de mise en œuvre d'InterSystems IRIS dans Docker:

  • extraction de l'image
  • démarrage et configuration des conteneurs
  • persistance des données avec %SYS durable
  • création d'images personnalisées avec votre propre code et vos propres scripts

Cela suffit pour commencer à expérimenter IRIS dans un environnement conteneurisé et l'utiliser pour le développement.

Un référentiel GitHub contenant tous les fichiers mentionnés dans la dernière partie (Docker Compose, Dockerfile, iris.script, etc.) est disponible.

Ne manquez pas le prochain article!

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Article Guillaume Rongier · Sept 2, 2025 6m read

img

Cet article présente une introduction à la programmation Python dans le contexte d'IRIS.

Avant toute chose, je vais aborder un sujet important : Fonctionnement de Python. Cela vous aidera à comprendre certains problèmes et certaines limites que vous pourriez rencontrer lorsque vous utilisez Python dans IRIS.

Tous les articles et exemples sont disponibles dans ce dépôt git: iris-python-article

Fonctionnement de Python

Langage interprété

Python est un langage interprété, ce qui signifie que le code est exécuté ligne par ligne lors de l'exécution, même lorsque vous importez un script.

Qu'est-ce que cela veut dire? Examinons le code suivant:

# introduction.py

def my_function():
    print("Hello, World!")

my_function()

Lorsque vous exécutez ce script, l'interpréteur Python lit le code ligne par ligne. Il définit d'abord la fonction my_function, puis appelle cette fonction, qui affiche "Hello, World!" à la console.

Exemple d'exécution directe du script:

python3 /irisdev/app/src/python/article/introduction.py 

Cela donnera le résultat suivant:

Hello, World!

Dans un contexte IRIS, que se passera-t-il si nous importons ce script ?

Class Article.Introduction Extends %RegisteredObject
{
    ClassMethod Run()
    {
        Set sys = ##class(%SYS.Python).Import("sys")
        do sys.path.append("/irisdev/app/src/python/article")

        do ##class(%SYS.Python).Import("introduction")
    }
}

Lançons-le:

iris session iris -U IRISAPP '##class(Article.Introduction).Run()'

Cela donnera le résultat suivant:

Hello, World!

En effet, l'interpréteur Python importe le code en l'interprétant, il définit d'abord la fonction, puis l'appelle, exactement comme si vous exécutiez le script directement mais vous ne l'exécutez pas, vous l'importez.

⚠️ Remarque importante : si vous importez le script sans appeler la fonction, rien ne se passera. La fonction est définie, mais elle ne s'exécutera pas jusqu'à ce que vous l'appeliez explicitement.

Compris? L'interpréteur Python exécute le code dans le fichier, et si vous n'appelez pas la fonction, elle ne s'exécutera pas.

Exemple d'importation sans appel:

# introduction1.py
def my_function():
    print("Hello, World!")

Lançons-le dans un interpréteur Python:

python3 /irisdev/app/src/python/article/introduction1.py 

Résultat:

# Aucun résultat, puisque la fonction est définie mais n'est pas appelée

Dans un contexte IRIS, si vous importez ce script:

Class Article.Introduction1 Extends %RegisteredObject
{
    ClassMethod Run()
    {
        Set sys = ##class(%SYS.Python).Import("sys")
        do sys.path.append("/irisdev/app/src/python/article")
        do ##class(%SYS.Python).Import("introduction1")
    }
}

Lançons-le:

iris session iris -U IRISAPP '##class(Article.Introduction1).Run()'

Vous ne verrez aucun résultat,puisque la fonction est définie mais n'est pas appelée.

🤯 Pourquoi cette nuance est-elle importante?

  • Lorsque vous importez un script Python, celui-ci exécute le code contenu dedans.
    • Vous ne souhaitez peut-être pas que cela se produise
  • Vous pouvez être dérouté en pensant que l'importation d'un script revient à l'exécuter, mais ce n'est pas le cas.

Mise en cache des importations

Lorsque vous importez un script Python, l'interpréteur Python met en cache le script importé. Cela signifie que si vous importez à nouveau le même script, il ne réexécutera pas le code de ce script, mais utilisera la version mise en cache.

Exemple:

Réutilisons le script introduction.py:

# introduction.py
def my_function():
    print("Hello, World!")

my_function()

Maintenant, faisons la même chose en réutilisant la classe Article.Introduction:

Class Article.Introduction Extends %RegisteredObject
{
    ClassMethod Run()
    {
        Set sys = ##class(%SYS.Python).Import("sys")
        do sys.path.append("/irisdev/app/src/python/article")
        do ##class(%SYS.Python).Import("introduction")
    }
}

Mais maintenant, nous allons l'exécuter deux fois de suite dans la même session IRIS:

iris session iris -U IRISAPP 

IRISAPP>do ##class(Article.Introduction).Run()
Hello, World!

IRISAPP>do ##class(Article.Introduction).Run()

IRISAPP>

🤯 Mais qu'est-ce que c'est que ça ?

Oui, Hello, World! n'est imprimé qu'une seule fois !

⚠️ Votre script importé est mis en cache. Cela signifie que si vous modifiez le script après l'avoir importé, les modifications ne seront pas prises en compte tant que vous n'aurez pas modifié la session IRIS.

Cela vaut également si vous utilisez la balise de langage python language tag dans IRIS:

Class Article.Introduction2 Extends %RegisteredObject
{

ClassMethod Run() [ Language = python ]
{
    import os

    if not hasattr(os, 'foo'):
        os.foo = "bar"
    else:
        print("os.foo already exists:", os.foo)
}

}

Lançons-le:

iris session iris -U IRISAPP

IRISAPP>do ##class(Article.Introduction2).Run()

IRISAPP>do ##class(Article.Introduction2).Run()
os.foo already exists: bar

Oh non, le module os est mis en cache et l'attribut foo n'est pas redéfini comme inexistant.

Conclusion

J'espère que cette introduction sera utile pour comprendre pourquoi, lorsque vous travaillez avec Python dans IRIS, vous pouvez rencontrer des comportements inattendus, notamment lors de l'importation de scripts et de la mise en cache.

À retenir lorsque vous travaillez avec Python dans IRIS:

  • Changez à chaque fois de session IRIS pour voir les modifications apportées à vos scripts Python.
    • Il ne s'agit pas d'un bug, c'est le fonctionnement normal de Python.
  • N'oubliez pas que l'importation d'un script exécute son code.

Bonus

Attendez! C'est illogique, si vous dites que lorsque vous importez un script, il est mis en cache. Pourquoi, lorsque je travaille avec la balise language tag = python, lorsque je modifie le script, cela fonctionne sans changer la session IRIS?

Bonne question, cela est dû au fait que la balise language tag est conçue pour que, chaque fois que vous l'exécutez, elle relise le script et l'exécute ligne par ligne comme s'il s'agissait de nouvelles lignes dans un interpréteur Python natif. La balise language tag n'importe pas le script, elle l'exécute simplement comme si vous l'exécutiez directement dans un interpréteur Python sans le relancer.

Exemple:

Class Article.Introduction2 Extends %RegisteredObject
{
ClassMethod Run() [ Language = python ]
{
    import os

    if not hasattr(os, 'foo'):
        os.foo = "bar"
    else:
        print("os.foo already exists:", os.foo)
}
}

Lançons-le:

iris session iris -U IRISAPP
IRISAPP>do ##class(Article.Introduction2).Run()

IRISAPP>do ##class(Article.Introduction2).Run()
os.foo already exists: bar  

Dans un interpréteur Python, cela se présentera comme suit:

import os

if not hasattr(os, 'foo'):
    os.foo = "bar"
else:
    print("os.foo already exists:", os.foo)

import os
if not hasattr(os, 'foo'):
    os.foo = "bar"
else:
    print("os.foo already exists:", os.foo)

Résultat:

os.foo already exists: bar # only printed once

Maintenant, c'est clair?

Suite:

  • Pep8
  • Modules
  • Méthodes Dunder
  • Utilisation de Python dans IRIS
  • ...
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Article Sylvain Guilbaud · Mai 27, 2025 7m read

Je sais que ceux qui découvrent VS Code, Git, Docker, FHIR et d'autres outils peuvent parfois avoir des difficultés à configurer l'environnement. J'ai donc décidé de rédiger un article qui explique étape par étape l'ensemble du processus de configuration afin de faciliter les premiers pas.

Je vous serais très reconnaissant de bien vouloir laisser un commentaire à la fin de cet article pour me faire savoir si les instructions étaient claires, s'il manquait quelque chose ou si vous avez d'autres suggestions qui pourraient être utiles.

La configuration comprend:

✅ VS Code – Éditeur de code
✅ Git – Système de contrôle de version
✅ Docker – Lancement d'une instance de la communauté IRIS for Health
✅ Extension VS Code REST Client – Pour l'exécution de requêtes API FHIR
✅ Python – Pour l'écriture de scripts basés sur FHIR
✅ Jupyter Notebooks – Pour les tâches liées à l'IA et au FHIR

Avant de commencer: Vérifiez que vous disposiez des privilèges d'administrateur sur votre système.

Outre la lecture du guide, vous pouvez également suivre les étapes décrites dans les vidéos:

Pour Windows

<iframe allowfullscreen="" frameborder="0" height="360" src="https://www.youtube.com/embed/IyvuHbxCwCY" width="640"></iframe>

Pour macOS

<iframe allowfullscreen="" frameborder="0" height="360" src="https://www.youtube.com/embed/Ss7vU0l3JNU" width="640"></iframe>

Vous trouverez un sondage à la fin de l'article, merci de partager vos progrès. Vos commentaires sont très appréciés.

Alors, c'est parti!

1. Installation de Visual Studio Code (VS Code)

VS Code sera l'éditeur principal pour le développement.

Windows et amp; macOS

  1. Accédez à la page de téléchargement de VS Code: https://code.visualstudio.com/
  2. Téléchargez le programme d'installation pour votre système d'exploitation:
    • Windows: .exe file
    • macOS: .dmg file
  3. Exécutez le programme d'installation et suivez les instructions.
  4. (Windows uniquement) : pendant l'installation, cochez la case Add to PATH" (Ajouter au PATH).
  5. Vérifiez l'installation:
  • ouvrez un terminal (Command Prompt, , PowerShell ou Terminal macOS)
  • Exécutez:
code --version
  • Vous devriez voir le numéro de version.

2. Installation de Git

Git est nécessaire pour le contrôle de version, le clonage et la gestion des référentiels de code.

Windows

  1. Téléchargez la dernière version à partir de: https://git-scm.com/downloads
  2. Exécutez le programme d'installation:
    • Choisissez "Use Git from the Windows Command Prompt" (Utiliser Git à partir de l'invite de commande Windows).
    • Conservez les paramètres par défaut et terminez l'installation.
  3. Vérifiez l'installation:
git --version

macOS

  1. Ouvrez le terminal et exécutez:
git --version

Si Git n'est pas installé, macOS vous demandera d'installer les outils de ligne de commande Suivez les instructions.

3. Installation de Docker

Docker est indispensable pour exécuter InterSystems IRIS for Health Community.

Windows

1.    Téléchargez Docker Desktop à partir de: https://www.docker.com/products/docker-desktop
2.    Exécutez le programme d'installation et suivez les instructions.
3.    Redémarrez votre ordinateur après l'installation.
4.    Activez WSL 2 Backend (si cela vous est demandé).
5.    Verifiez l'installation

À remarquer: L'installation de Docker nécessite des privilèges d'administrateur sur votre machine et au moins un redémarrage.

macOS

1.    Téléchargez Docker Desktop pour Mac à partir de: https://www.docker.com/products/docker-desktop
2.    Installez-le en glissant Docker.app dans le dossier Applications.
3.    Ouvrez Docker à partir du menu Applications.

Pour vous assurer que le moteur Docker Desktop fonctionne sous Windows ou macOS, procédez comme suit:

Démarrez Docker Desktop

Windows: Ouvrez Docker Desktop à partir du menu Start. L'icône Docker en forme de baleine devrait apparaître dans votre barre d'état système.

Mac: Lancez Docker Desktop à partir du dossier Applications. Une fois l'application lancée, l'icône Docker en forme de baleine apparaîtra dans la barre de menu.

Attendez l'initialisation

Une fois que vous avez lancé Docker Desktop, le moteur peut prendre un certain temps à démarrer. Recherchez un message d'état indiquant que Docker est "running" (en cours d'exécution) ou "started" (démarré).

Vérifiez via le terminal/Command Prompt:

Ouvrez le terminal (ou Command Prompt/PowerShell pour Windows) et exécutez:

docker --version

ou

docker info

Dépannage

Si le moteur ne fonctionne pas, essayez de redémarrer Docker Desktop ou vérifiez s'il y a des messages d'erreur dans l'interface utilisateur de Docker Desktop. Assurez-vous également que votre système répond aux exigences de Docker Desktop. Vous pouvez voir des messages d'erreur confus faisant référence à des pipes si vous essayez de créer une image Docker sans que Docker Desktop soit en cours d'exécution.

4. Création de l'image IRIS for Health et son exécution à l'aide de Docker

Avant de pouvoir démarrer un conteneur Docker exécutant IRIS for Health Community (qui comprend notre serveur FHIR), nous devons le créer.

  1. Clonez le référentiel FHIR dans un répertoire approprié de votre système de fichiers. Ouvrez un terminal dans VS Code et clonez ce référentiel à l'aide de la commande suivante:
    git clone https://github.com/pjamiesointersystems/Dockerfhir.git
     
  2. Accédez à ce répertoire et ouvrez le dossier dans VS Code. Suivez les instructions du fichier readme pour créer et exécuter le conteneur. Une étape essentielle consiste à vous assurer que le référentiel de base est disponible dans votre magasin Docker. Vous pouvez le faire à l'aide de la commande dans le terminal VS Code:
    docker pull containers.intersystems.com/intersystems/irishealth-community:latest-em
    Vous devriez recevoir une confirmation après quelques minutes.
  3. Accédez au répertoire dans VS Code où se trouve le fichier docker-compose.yaml, puis exécutez la commande suivante:
    docker-compose build 
    Cela lancera le processus de compilation, qui peut prendre jusqu'à 10 minutes, au cours desquelles un référentiel FHIR complet sera créé et chargé avec un échantillon de patients. 
  4. Une fois le processus de compilation terminé, lancez le conteneur à l'aide de la commande suivante:
    docker-compose up -d
    suivi par
    docker ps
    Vous devriez voir un conteneur nommé **iris-fhir** en cours d'exécution. Si le conteneur ne démarre pas, vérifiez les journaux:
    docker logs iris-fhir
     

5. Installation de l'extension VS Code REST Client

Cette extension vous permet d'envoyer des requêtes API FHIR depuis VS Code.

  1. Ouvrez VS Code.
  2. Accédez aux extensions (Ctrl + Shift + X or Cmd + Shift + X on macOS).
  3. Recherchez "REST Client". Il existe plusieurs clients REST, veuillez installer celui-ci:
  4. Clickez le bouton "Install".

6. Installation de Python

Python est indispensable pour les tâches de programmation liées à FHIR.

Windows

1.    Télécharger Python à partir de: https://www.python.org/downloads/
2.    Exécutez le programme d'installation et cochez la case "Add to PATH" (Ajouter au chemin). Vous aurez besoin d'informations d'identification administratives pour apporter des modifications au chemin d'accès
3.    Terminez l'installation.
4.    Verifiez l'installation:

python --version

macOS

  1. Ouvrez le Terminal et installez Python via Homebrew:
    Brew install python
    Si vous n'avez pas d'Homebrew, installez-le d'abord:
    /bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)"
     
  2. Verifiez l'installation:
python3 --version

7. Installation des blocs-notes Jupyter

Les notebooks Jupyter sont utilisés pour l'IA et le FHIR, ainsi que pour les tâches  FHIR SQL.

Windows & macOS

  1. Ouvrez le terminal (Command Prompt, PowerShell, ou macOS Terminal).
  2. Installez Jupyter à l'aide de pip:
    pip install jupyter
    jupyter --version
     
  3. Exécutez le bloc-note Jupyter:
jupyter notebook

Jupyter s'ouvrira alors dans votre navigateur web.

8.  Validation

Exécutez votre conteneur en accédant à votre fichier Docker Compose dans le shell. Exécutez la commande 

docker compose up -d
docker ps

Accédez au Portail de gestion d'IRIS:

  • Ouvrez votre navigateur et accédez à: http://localhost:8080/csp/sys/UtilHome.csp
  • Informations d'identification par défaut:

Nom d'utilisateur: _SYSTEM
Mot de passe: ISCDEMO

Accédez à l'API FHIR

  • Ouvrez votre navigateur et accédez à: http://localhost:8080/csp/healthshare/demo/fhir/r4/metadata

Dernières vérifications

Exécutez les commandes suivantes pour vérifier toutes les installations:

code --version       # VS Code
git --version        # Git
docker --version     # Docker
python --version     # Python
jupyter --version    # Jupyter

Si tout fonctionne, vous avez installé correctement tous les logiciels ci-dessus.

Dépannage

ProblèmeSolution
"Command not found" (Commande introuvable) pour n'importe quel outilVérifiez qu'il a bien été ajouté au PATH (chemin) (réinstallez-le si nécessaire).
Docker ne fonctionne pas sous WindowsRedémarrez Docker Desktop et vérifiez que WSL 2 backend est activé.
Le conteneur IRIS ne démarre pasExécutez docker logs iris-fhir pour vérifier les erreurs.
Impossible d'accéder à l'API FHIR Vérifiez que le conteneur est en cours d'exécution (docker ps).

Merci de votre aide. J'attends vos commentaires avec impatience!

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